第一季的最后一集，当迈克和林肯他们跑到黑帮老大阿布鲁奇派来的飞机所停泊的地方时，飞行员因为安全问题而没等到他们就离开了逃脱的囚犯们只能望天长叹，于是，他们各自展开了逃亡生涯FBI追捕逃犯的资深探员马宏在副总统的授权下成为捉捕小组的主管，他决定逐个击破另一方面，莎拉的父亲因为林肯这起案件而遭灭口，她开始相信麦克了，并从父亲…

迈克尔·斯科菲尔德正陷于无望的困境中——他的哥哥林肯·巴罗斯被认定犯有谋杀罪被投入了FoxRiver监狱的死囚牢虽然所有的证据都指出林肯就是凶手，迈克尔却坚信兄长是无辜的林肯的死刑执行日越来越逼近，在没有其他选择的情况下，迈克尔持枪闯入了一家银行，被捕入狱后来到了林肯的身边身为建筑工程师的迈克尔参与了监狱的改造工程而对这里了若…