全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年千空苏醒了。 从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！，在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界。

全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了面对文明毁灭的石之世界（STONEWORLD），千空决定依靠科学的力量取回原本的世界。他召集新的伙伴，创立了『科学王国』。火、铁、电气、玻璃、手机……千空等人开始跨越从石器时代到现代文明的200万年科学史。但号称灵长类最强的高中生·狮…

日向梦是非常明亮有精神的初中1年级学生。她在入学仪式的前一天，捡到了从天上掉下来的神秘玩偶。那只毛绒玩具自称为美姬，它告诉梦，如果它和伙伴心灵相通的话，就可以进入和伙伴同样的梦境一起玩耍……

在帕特里亚大陆诞生的民主主义国家“帕特里亚”。在由于经济不平衡而导致分裂成“北部帕特里亚同盟”与“南部帕特里亚联合”的这个国家，持续着长年的内战。陷入了劣势的北部，为了战胜南部，终于用上了禁忌的技术。将人类改造成异形士兵的这个技术，以人类的模样为代价，获得与神媲美的力量。这个力量结束了长期的战乱，从此进入了和平年代。“…

全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。在文明遭到毁灭的石之世界（STONEWORLD）里，千空决定要用科学的力量复原整个世界。而与此同时苏醒过来的有，以有着过人体力的儿时玩伴·大木大树为首的伙伴们，从零开始创造文明——从石器时代到现代文明，绝对要赶上这科学史的200万年差距！前所未…

　　全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。“从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。                            

故事发生在风景秀丽的冈山县，绘里飘（菲鲁兹·蓝配音）是生活在这里的一名普通女性，然而，她还有着另一重身份——狂热偶像宅。绘里飘所支持的，是偶像团体“ChamJam”里名为市井舞菜（立花日菜配音）的成员，绘里飘是只应援舞菜一人的唯粉，她将自己所有的收入都贡献给了舞菜，工作之余的所有时间经历也都投注到了舞菜的身上。偶像团体里雷打…

少女宫下藤花，当她察觉到“世界之敌”的时候便会诞生出另一个名为“不吉波普”的人格。围绕着各种奇怪的事件，少年与少女们的故事慢慢展开了——

全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了在文明遭到毁灭的石之世界（STONE WORLD）里，千空决定要用科学的力量复原整个世界。而与此同时苏醒过来的有，以有着过人体力的儿时玩伴·大木大树为首的伙伴们，从零开始创造文明——从石器时代到现代文明，绝对要赶上这科学史的200万年差距！前所未闻…

曾经的妖精、现在却成为了“兵器”。 在这个世界上，存在着依附于动物的不可思议的力量，妖精。将妖精依附的动物的内脏器官摘除并移植到人类身上，妖精在人类身上分身出现而当作兵器被使用。自如操纵妖精作为战争道具的士兵们，他们被称为“妖精兵”。在长期的战争结束后，他们结束了使命、失去了容身之处。有的成为了政府人员，有的成为黑手党…