黑猫警长的故事基本上是发生在一片森林里。森林公安局的黑猫警长带着它的部属白猫班长、白鸽侦探及众多警员侦破案件，维护森林的和平。黑猫警长、白猫班长、白鸽侦探、一只耳（老鼠）等是本动画的主要角色。

该片以陈炯明叛乱和省港大罢工为历史背景，讲述了廖仲恺、何香凝夫妇追随孙中山革命路线，改组国民党，与国民党右派、军阀势力进行复杂斗争，最后为促成国共两党合作而献身的故事。

在该动画片中，机智、勇敢、帅气的黑猫警长率领警士侦破了一个又一个危害森林安全的案件，令森林中的各种动物得以过上安枕无忧的日子。《痛歼搬仓鼠》一集，它用现代化武器歼灭了一群深夜袭击粮仓的老鼠；《空中擒敌》一集，它用直升机逼巨大的怪兽现出原形；《吃红土的小偷》一集，它处罚了偷吃红土的大象、河马和野猪；《吃丈夫的螳螂》一集，…