该剧主要讲述从身任警方卧底成功捣毁黑帮后重返警局的警员高家声、PTU女沙展何慧玲和铁面无私的队长刘建晖为主人公进行展开的故事。三人在PTU虽然有误会、矛盾与冲突，但在执行任务、面对瞬间生死后，逐渐建立起真正的同僚友谊，成为了真正的好警察。

CIB（Criminal Intelligence Bureau）是香港警察最秘密的组织。他们主要是通过掩饰和装扮其真面目和身份来跟踪及拘捕指定的目标及犯罪者。这个行动称为“Eye In The Sky”。一次，CIB的领导者Matt接到一个关于珠宝劫案的任务，于是就派了他的组员分别监视怀疑人物。殊不知，那个珠宝劫匪的头领最擅长的本领就是摆脱警察的跟踪。

五个配合默契的杀手中有一人突然金盆洗手，并且带着妻子远离尘嚣，在澳门过着恬静的生活。一天，当年的四个同伴先后出现在澳门，五人重新聚首百感交集。但是每个人心底里都有不同的盘算和目的，其中有人更是仇家派来杀人灭口的。与此同时，另外几名杀手也肩负使命出现在澳门，于是平静的小镇掀起了连场激斗。直到最后大家面对彼此紧扣扳机的时候…

大脑是职业暗杀者，擅于策划天衣无缝的暗杀布局，行凶手法能令目标人物葬身于意外之中，遇害者表面上死于非命，案情却是暗杀组成员一起策动的惊心杀人行动。在执行一次任务途中，计划突然变化，进而到了不可收拾的地步。日复日的杀人行动，为大脑带来思绪压力，常梦见自己死于意外之中。

反黑组警长警长肥沙，不慎丢失手枪。这件事非同小可，如果手枪被匪徒用去行凶，肥沙将大祸临头。PTU警官何文展出于义气，答应一定会在天亮之前寻回手枪，带几名手下开展了寻枪行动。另一方面，却在横生枝节：警员Kat死守纪律，坚持要将此事汇报上级处理；而在同一晚，CID的Madam张在接手一单黑社会谋杀案时，怀疑肥沙与黑社会有染，由此与PTU…

党首哥顿连同数名不同背景的贼党策划了连环洗劫金行大买卖。行动当日，警方以李Sir为首与匪徒发生激烈枪战，械劫兵团四处逃窜，其中阿虎与阿龙一同杀出重围，而其他党羽却死在警方乱枪之下。老鼠怀疑阿龙是警方卧底，与阿龙发生激烈冲突，阿虎一力保着阿龙，拿出手枪互相恐吓，幸在最后关头豺狼突然出现，平息了两人风波。豺狼准备烧死劫回来的…

　森和May各自带领的机动小组成员间争强好胜，May的小组得到何长官赏识，娇纵傲慢，森一队心有不服，却无可奈何。机动小组即将解散，但在执勤的最后一天发生一起抢劫案，劫匪逃入荒山。两支小组并为一队上山展开地毯式搜查。期间各种离奇状况不断，加上彼此矛盾重重，致使森和May分头行动，却遭遇诸多险阻。另一方面，为队员送饭的肥棠汽车抛锚…

组建一年多的机动部队即将解散，偏偏最后一天的突发任务十分艰巨——搜索潜入深山里的亡命劫匪。森哥与May姐带领的两队警员因为长期赏罚不公矛盾尖锐，最后一天的终极任务暗中较劲，力争表现邀功。深山搜人时，两队警员更是明争暗斗导致状况百出。行动中除了警匪双方的混战还杀出了来历不明的第三方，并给警队带来致命伤害。在孤立无援的情况下…

曾混迹黑社会的印度裔男子维路出狱后，一心过回正常人生活，可惜人在江湖，身不由己。他最疼爱的弟弟跟随当年好友混入黑道；曾经的老大黑摩利据说也返回香港，图谋杀害机动部队陈督察；警官肥棠则隔三差五找到维路了解线索。维路不胜其扰，却又无可奈何。另一方面，香港油尖旺鱼龙混杂，各方势力暗流涌动。森和May所率领的机动部队一面要平息黑…

重案组肥棠（林雪饰）嗜赌成性欠下高利贷，终日被放债人陈耀雄（林家栋饰）追讨。肥棠被逼无奈，竟打起警署内赃款的主意，他盗取赃款却仍填不上债务窟窿，只好藏进小旅馆躲避陈耀雄。PTU的沙展阿森（任达华饰）得知肥棠私盗赃款，想方设法保护和帮助好友，却毕竟能力有限。偶然机会，肥棠和隔壁四个潮州同乡相识，更因其专业车手的经历和技术得…