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本剧剧情发生在《星球大战2:克隆人的进攻》与《星球大战3:西斯的复仇》之间,讲述了历时三年的克隆人战争期间的一些事件银河共和国的大共和军在尤达大师、梅斯·温杜、欧比旺·肯诺比、安纳金·天行者和其他绝地武士的带领下,对抗独立星系邦联的战斗机器人部队
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经过三年残酷的战争,Clone Wars己差不多接近尾声,绝地议会派遣Obi派遣ObiWan Kenobi把致命的分离份子机械军队首令回来受审同时,在Coruscant,Chancellor Palpatine的势力日渐壮大,他已把饱受战火洗礼的共和国转形至帝国。他的密友天行者阿纳金Anakin Skywalker已显露了他的真正力量,他的秘密已诱惑他走到崇尚武力的黑暗面……