猪猪侠接到新任务，就是在神秘而美丽的南海搜集寻找各种海洋生物，调查并记录它们的生存环境和独特行为为了保护海洋生态环境、记录大开眼界的见闻，猪猪侠与伙伴阿五、聪聪组成探险小队，不但要面对海底世界的种种困难，还要与一个叫坏坏博士的竞争者斗智斗勇。

《猪猪侠之南海日记第二季》是猪猪侠全新番外科普系列动画片，讲述了超星特工猪猪侠和阿五结束恐龙世界的探险后，前往神秘的南海，调查海洋生物、完成记录的探险故事。

地球的能源核心“核晶”遭到了外星球钶龙奥米伽的抢夺，核晶守护者力奥和剑齿虎奋力保护。在战斗中，核晶被分裂成十块碎片去到不同的时空。机缘巧合下，主角乐小宇成为新的核晶守护者，他需要穿越时空，寻找核晶碎片。

跟猪猪侠星航志同道合的新能源引擎专家马力博士，加入超星车队帮助突破雷普森集团的技术封锁。赛场上的对手个个实力强劲，无论半决赛的出师不利还是星航的昔日师兄投身敌营，都予以超星车队不小的打击。猪猪侠和星航重拾信心，迎难而上，最终登上比云山颁奖台，也粉碎了雷普森集团。

猪猪侠、阿五重返恐龙星，意外唤醒机器人阿七，从而恢复了阿五真正的虎星人身份。猪猪侠因为担心阿五，陪着他一起完成试炼任务。为此，他们不仅要齐心协力走出恐龙世界的蛮荒环境，到达勋章所在地；还要突破重重关卡，取得试炼徽章。

猪猪侠、阿五重返恐龙星，意外唤醒机器人阿七，从而恢复了阿五真正的虎星人身份。猪猪侠因为担心阿五，陪着他一起完成试炼任务。为此，他们不仅要齐心协力走出恐龙世界的蛮荒环境，到达勋章所在地；还要突破重重关卡，取得试炼徽章。

猪猪侠和伙伴们每个人都有不同的职业，外星人潜伏在人们身边的各个角落，会以各种匪夷所思的方式出现而这一切，究竟是怎样发生的呢？猪猪侠必须带领伙伴们一一去揭秘…

猪猪们发现猪猪星变得混乱无序，竟然是因为被独孤博士移植很多的世界块块。为此，猪猪们耍起功夫，不断冲破独孤博士和他们手下带来的各种阻碍，前往每个世界块块内寻找世界引擎，阻止新世界块块的到来。

猪猪侠与伙伴们前往武林星收集能量魔方，阻止独孤博士融合星球的阴谋。他们来到平安客栈，找到在此隐居的隐世高手朱大常和朱大婶，排除万难学会了打出真气的方法。猪猪们穿梭于武林星的各地，和当地武术家展开各种功夫的精彩较量。最终猪猪们用苦练而来的功夫，赢得足够的魔方，并冲破王霸天设下的种种陷阱，成功阻止武林星和猪猪星的融合。

竞速之城是一座悬浮在空中的赛车城市。超星特工猪猪侠受邀出席最新赛季开幕式， 在这个时候，猪猪侠意外接到紧急任务：支撑悬浮的核心能源被盗，城市即将坠毁，猪猪侠必须在72小时内找回能源。一场惊险刺激的冒险赛程，就此展开。